거차수도 부근의 주요 어종은 우럭, 감성돔, 참돔, 돌돔, 농어, 부시리 등이다. 루어낚시, 지깅낚시는 그럽웜, 메탈지그, 미노우 플러그, 지그헤드 등을 사용하며, 민장대낚시, 부력찌낚시(고부력찌 반유동, 저부력찌 전유동), 원투낚시, 잠수찌낚시는 청갯지렁이, 홍갯지렁이, 크릴, 사백어, 민물새우 등을 사용한다. 동거차도와 서거차도에서 감성돔이 잘 올라오며 섬 전역이 감성돔 포인트라 봐도 무방하다. 또한 주변의 다른 섬에서도 감성돔이 잘 낚이는 편이다.