독거군도 부근의 주요 어종은 감성돔, 농어, 돌돔, 참돔, 볼락, 광어 등이다. 루어낚시는 그럽웜, 메탈지그, 미노우 플러그, 지그헤드 등을 사용하며, 릴찌, 민장대낚시, 부력찌낚시(고부력찌 반유동,저부력찌 전유동), 원투낚시, 잠수찌낚시는 크릴, 청갯지렁이, 성게, 소라, 오분자기, 게고둥, 참갯지렁이, 풀게, 바지락, 사백어, 민물새우. 곤쟁이, 새우살 등을 사용한다. 독거군도에서는 가을에 감성돔 조황이 좋다. 슬도, 죽항도, 관매도 등 숱한 섬들에서도 호황을 보인다. 또한 독거군도는 물색이 탁할수록 잡어가 적다.